Vieille de 2 000 ans, cette race bergère issue du molosse d'Epire a été préservée jusqu'au début du siècle dans les seules montagnes sauvages et rudes de la Yougoslavie (régions de Carso et d'Istrie). Les bergers l'élèvent encore pour protéger les troupeaux des attaques des loups et des ours.
Le Chien de Berger Yougoslave de Charplanina est élevé depuis les temps immémoriaux dans les régions montagneuses du Sud-Est de la Yougoslavie. Ce chien était le plus répandu dans la montagne de Charplanina, ce qui lui a valu son nom de ‘Charplaninatz. Aujourd'hui pourtant ce chien est élevé sur le territoire entier de la Yougoslavie. Cette race est enregistrée auprès de la F.C.I. depuis 1939 sous le numéro 41 et sous le nom suivant : Ilirski Ovcar (Chien de Berger d'Illyrie). En 1957, à la demande de la Fédération Cynologique Yougoslave, l'Assemblée Générale de la F.C.I. a autorisé que le nom de “Chien de Berger d'Illyrie” soit changé en “Chien de Berger Yougoslave de Charplanina”. On ne peut que supposer l'origine de cette race. Vraisemblablement que les chiens de cette race ont été amenés d'Asie en Europe lors des migrations des peuples aux temps préhistoriques et plus tard. Le type primitif de cette race ne s'est conservé que dans les régions où un élevage ovin extensif est encore pratiqué et où ce chien remplit toujours le rôle de gardien et de défenseur du troupeau contre les bêtes fauves.